teema: | QSPR/QSAR lähenemised keerulistele ja suurtele andmekomplektidele. |
---|---|
tunnusnumber: | ETF5386 |
projekti tüüp: | Eesti Teadusfondi grant |
erialad: |
1.6-1.9. Keemia ja molekulaarbioloogia 2. Tehnikateadused |
seisund: | käimasolev |
asutus: | TÜ Füüsika-keemiateaduskond |
projekti juht: | Sulev Sild |
kestus: | 01.01.2003 - 31.12.2006 |
kirjeldus: | Käesoleva projekti peamiseks eesmärgiks on välja töötada tarkvarasüsteem, mis muudaks olemasolevad QSPR/QSAR meetodid kättesaadavaks suuremõõtmelistele ja keerulistele andmekomplektidele. Kui tänapäevane tarkvara on praktikas rakendatav andmekomplaktidele, mille maht on kuni paar tuhat keemilist ühendit, siis antud projekti eesmärgiks on selle piiri viimine kümnete tuhandete või koguni sadade tuhandete ühendite piirimaale. Teiseks eesmärgiks on välja töötatava tarkvara praktiline testimine suuremõõtmelistel andmekomplektidel, mis hõlmavad erinevaid farmakoloogilisi ja tehnoloogilisi omadusi. Sellise arvutus- ja andmemahuka ülesande praktiliseks lahendamiseks on kõige otstarbekam kasutada võimsaid hajusüsteeme. Seega tasub tarkvara väljatöötamisel lähtuda ja ära kasutada olemasolevaid GRID standardeid ja infrastruktuure. Avatud standardite kasutamine võimaldab välja töötatavat tarkvarasüsteemi rakendada erinevates superarvutikeskustes, samuti saab süsteem laiendada ühilduvate tarkvaramoodulitega või integreerida teistesse tarkvarasüsteemidesse. Loodav tarkvarasüsteem hõlmab järgmiseid arvutuslikud etapid, mis on vajalikud QSPR/QSAR mudelite tuletamiseks: (1) kvantkeemilised arvutused (pool- ja mitteempiirilised kvantkeemia meetodid), (2) molekulaardeskriptorite arvutused, (3) lineaarsete või mittelineaarsete QSPR/QSAR mudelite tuletus (MLR, PLS, ANN jne). |
projektiga seotud isikud | ||||
---|---|---|---|---|
nr | nimi | asutus | amet | |
1. | Sulev Sild | TÜ Füüsika-keemiateaduskond | teadur |