| teema: | Rakku penetreeruvad peptiidid, mehhanism(id) ja rakendused. |
|---|---|
| tunnusnumber: | ETF5588 |
| projekti tüüp: | Eesti Teadusfondi grant |
| erialad: |
1.6-1.9. Keemia ja molekulaarbioloogia 2.7. Bio- ja toiduainete tehnoloogia 3. Arstiteadused |
| seisund: | käimasolev |
| asutus: | Eesti Biokeskus |
| projekti juht: | Margus Pooga |
| kestus: | 01.01.2003 - 31.12.2006 |
| kirjeldus: | Teatavat klassi peptiidide ja valkude võime rakkudesse siseneda näiliselt ilma raku energiat kasutamata ja ilma mebraanivalkude vahenduseta on nüüdseks teada olnud juba kümme aastat. Selliseid peptiide, mis muuhulgas suudavad rakkudessse siseneda ka madalatel temeperatuuridel hakati nimetama rakku penetreeruvateks peptiidideks (RPP), eristamaks neid peptiididest ja valkudest, mis viiakse raku sisemusse endotsütoosi vahendusel. RPP-sid on kasutatud erineva suuruse ja iseloomuga molekulide, mis ise ei ole võimelised plasmamembraani läbima, transportimiseks elusrakkudesse. Nii on rakku sisestatud polüpeptiidide abil inhibeeritud ensüüme rakus ja moduleeritud signaaliülekannet, polünukleotiidide abil mõjutatud mitmete valkude ekspressiooni. Vaatamata intensiivsetele uuringutele ja erinevate meetodite rakendamisele ei ole õnnestunud selgitada ei mehhanismi, mida kasutades RPP-d rakku sisenevad ja seal kontsentreeruvad ega ka defineerida seda suunavat jõudu või kontrollivat energiat. Käesolevas projektis planeerime uurida RPP-de rakku internaliseerumise mehhansimi(e), keskendudes järgmistele küsimustele: Kas kõik RPP-d kasutavad rakku sisenemiseks sama mehhanismi? Kas CPP-de rakku sisenemine efektiivsus sõltub lipiidide organiseeritusest plasmamembraanis? Millised jõud põhjustavad RPP-de sisenemist rakkudesse ja seal kontsentreerumist? Kas RPP-de internaliseerumise efektiivsus sõltub rakumembraani potentsiaalist? Kas RPP-de interaktsioon plasmamembraaniga või sisenemine rakku mõjutab raku polariseeritust? Millised rakulised protsessid hõlbustavada RPP-de ja RPP-valk komplekside sisenemist rakku? Kuidas ja milliste mehhanismide abil toimub RPP-dega rakku viidud molekulide liikumine ja ümberjaotumine raku sisemuses? Kas on võimalik luua RPP-sid, mis siseneks selektiivselt ainult teatud tüüpi rakkudesse või kudedesse või raku sees spetsiifiliselt soovitud organelli? Kuidas RPP-d läbivad rakulisi barjääre ja transpordivad molekule sihtmärkideni läbi mite rakukihi ? |
| projektiga seotud isikud | ||||
|---|---|---|---|---|
| nr | nimi | asutus | amet | |
| 1. | Sulev Kuuse | TÜ BGMR | vivaariumi juhataja | |
| 2. | Kärt Padari | TÜ BGZH | doktorant | |
| 3. | Margus Pooga | Eesti Biokeskus | vanemteadur | |
| 4. | Raivo Raid | TÜ BGZH | dotsent | |