teema: | Stressivastuse ja apoptoosi mehhanismide iseloomustamine. |
---|---|
tunnusnumber: | ETF6000 |
projekti tüüp: | Eesti Teadusfondi grant |
erialad: |
1.8. Molekulaarbioloogia 1.9. Geneetika, füsioloogia ja mikrobioloogia 3.1. Biomeditsiin |
seisund: | käimasolev |
asutus: | Eesti Biokeskus |
projekti juht: | Tõnis Örd |
kestus: | 01.01.2004 - 31.12.2007 |
kirjeldus: | Homöostaasi rikkuvad tingimused käivitavad rakus mehhanismid, mis aitavad tekitatud kahjustusi parandada ja uuesti saavutada homöostaatilist seisundit. Teatud piiri ületava kahjustuse korral võib rakus käivituda apoptoos e. programmeeritud ("füsioloogilise") surma protsess, mille abil kahjustatud rakk kõrvaldatakse, vähendades niimoodi selle ebasoodsat mõju ümbritsevale koele ja likvideerides potentsiaalse ohu allika organismile tervikuna. Transkriptsiooni ja translatsiooni inhibiitorid blokeerivad apoptoosi, mis on esile kutsutud mitmete erinevate stressiolukordade poolt (kaltsiumi homöostaasi häired, hüpoksia, kasvufaktorite puudus, oksüdatiivne stress), viidates sellele, et de novo RNA ja valkude süntees võib etendada olulist rolli rakusurma protsessis. Et selgitada, millised geenid on närvirakkudes indutseeritud oksüdatiivse stressi ja kaltsiumi homöostaasi häirete korral (mida seostatakse neuropatoloogiliste seisunditega), viisime me läbi butioniinsulfoksimiini (glutatiooni sünteesi inhibiitor) ja tapsigargiini (endoplasmaatilise retiikulumi Ca-ATPaasi inhibiitor) toimel hiire neuronaalses rakuliinis aktiveerunud geenide diferentsiaalse kloneerimise. Üks meie poolt kloneeritud geenidest, millele andsime nime mNIPK, kodeerib põhiliselt rakutuumas paiknevat kinaasi-taolist valku. Uurides mNIPK-i interaktsioone teiste valkudega leidsime, et mNIPK seondub bZip transkriptsiooni-faktoriga ATF4 ja inhibeerib selle transkriptsioonilist aktiivsust. Projekti üheks eesmärgiks on mNIPK-i (ja mNIPK-i inimese homoloogi) omaduste, funktsioonide ja ekspressiooni regulatsiooni selgitamine. ATF4 etendab tähtsat rolli mälu kujunemisel ja geenide ekspressiooni reguleerimisel erinevates stressitingimustes (aminohapete puudus, oksüdatiivne stress, kaltsiumi ainevahetuse häired, endoplasmaatilise retiikulumi stress), samuti on ta hädavajalik organismi normaalseks arenemiseks (osaleb silma ja hematopoeetilise süsteemi arengus). ATF4 märklaudgeenide hulgas on nii rakku kaitsvaid (HO-1) kui ka stressi suhtes tundlikumaks muutvaid geene (CHOP), ja seega võib NIPK ATF4 repressorina olla ühenduses raku nii pro- kui antiapoptootiliste radadega. Lisaks mNIPK-ile oleme identifitseerinud kolm seni kirjeldamata geeni, mis indutseeritakse oksüdatiivse stressi või anti-apoptootilise faktori poolt, ja nende geenide iseloomustamine on samuti selle projekti eesmärgiks. |
projektiga seotud isikud | ||||
---|---|---|---|---|
nr | nimi | asutus | amet | |
1. | Olev Kahre | TÜ TI | spetsialist | |
2. | Daima Örd | TÜ MRI | doktorant; vanemlaborant | |
3. | Tõnis Örd | Eesti Biokeskus | vanemteadur |