teema: Proteiin kinaaside signaalisüsteemid eukarüootses rakutsüklis
tunnusnumber: ETF6766
projekti tüüp: Eesti Teadusfondi grant
erialad: 1.7. Orgaaniline ja biokeemia
seisund: käimasolev
asutus: TÜ Tehnoloogiainstituut
projekti juht: Mart Loog
kestus: 01.01.2006 - 31.12.2009
kirjeldus: Proteiin kinaasid on kesksed regulatoorsed molekulid kõigis tähtsamates rakuprotsessides ja defektid kinaaside signaaliradades on seotud paljude haigustega, kaasaarvatud vähktõvega. Projektis pühendun kinaaside poolt reguleeritavate signaalisüsteemide uurimisele, keskendudes mehhanismidele, mis määravad kinaaside substraadispetsiifilisuse.
Hiljuti näitasime, et rakutsükli keskse regulaatori, tsükliinidest-sõltuva proteiini kinaasi Cdk1, substraadispetsiifilisus on differentsiaalselt moduleeritud erinevate tsükliini alaühikute poolt. Järgnevalt leidsime, et erinevad tsükliinid mõjutavad graduaalselt nii Cdk1 kineetilisi omadusi, kui ka G2/M-inhibitoorse türosiini kinaasi Swe1 spetsiifilisust Cdk1 suhtes. Selline ainulaadne fenomen näitab, et Swe1 toimib “Km-i sensorina”, tundes ära milline tsükliin on seostunud Cdk1-ga. See omakorda võimaldab S-faasi ja M-faasi-spetsiifiliste Cdk1 signaalide effektiivse lahutamise kindlustades, et DNA replikatsioon eelneb mitoosile. Projekti esimeses osas plaanin ma rakendada erinevaid strateegiaid selle täiesti uudse rakutsükli regulatsiooni kontseptsiooni molekulaarse tagapõhja uurimiseks.
Projekti teises osas plaanin uurida rakutsükli kinaaside multi-fosforüleerimise protsessi mehhanismi ja funktsiooni. Enamik kinaase fosforüleerib oma substraatvalke mitmetes aktseptorsaitides, kuid sellise mehhanismi põhjuseid on väga vähe uuritud.
Kolmas projektis esitatud suund on mass-spektromeetrial baseeruv kinaaside füsioloogiliste substraatide otsimine kasutades innovatiivseid keemilisel geneetikal põhinevaid meetodeid. Need meetodid kasutavad spetsiifiliselt modifitseeritud ATP-taskuga kinaase ja selektiivseid inhibiitoreid või ATP-analooge nende kinaaside spetsiifiliseks testimiseks bioloogilistes ekstraktides või in vivo. Eesmärk on avastada uusi füsioloogilisi substraate kinaasidele, mis on seotud rakutsükli regulatsiooni ja vähktõvega.

projektiga seotud isikud
nr nimi asutus amet  
1.Mart LoogTartu Ülikooli Tehnoloogiainstituut