[ sulge aken ]

Elulookirjeldus (CV)
1.Eesnimi Maia
2.Perekonnanimi Kivisaar
3.Töökoht Tartu Ülikooli Molekulaar- ja Rakubioloogia Instituut
4.Ametikoht Geneetika õppetooli dotsent
5.Sünniaeg 02.06.1960 (päev.kuu.aasta)
6.Haridus Tartu Ülikool, bioloogia eriala (geneetika) 1983;
Tartu Ülikool, Ph.D. (molekulaarbioloogia) 1992;
EMBO lühiajaline järeldoktorantuur Uppsala Ülikoolis BMC-s (1994)
7.Teenistuskäik 1983-1986 TÜ Geneetika ja Tsütoloogia kateeder, n. teadur
1986-1991 TÜ plasmiidibioloogia labori n.teadur
1991-1992 TÜ Molekulaar-ja Rakubioloogia Instituut, teadur
1992-1993 TÜ Molekulaar-ja Rakubioloogia Instituut, v. teadur
alates 1993. a. septembrist samas instituudis dotsent
8.Teaduskraad PhD (molekulaarbioloogia)
9.Teaduskraadi välja
andnud asutus, aasta		 Tartu Ülikool, 1992
10.Tunnustused 1992 Eesti vabariigi teaduspreemia kollektiivi liikmena
2005 eesti vabariigi teaduspreemia keemia ja molekulaarbioloogia alal uurimuste tsükli "Bakterigenoomi mutagenees-adaptatsioonimehhanism keskkonna stressi tingimustes" eest
11.Teadusorganisatsiooniline
ja –administratiivne
tegevus		 Õppetöö läbiviimine:
1)BGMR 03.034 Geneetika 1; 2 AP; 350 üliõpilast aastas
2)BGMR 03.035 Geneetika 2; 2 AP; 150 üliõpilast aastas
3)BGMR 03.030 Bakterifüsioloogia molekulaarsed alused; 2 AP; 15-20 üliõpilast aastas
4)BGMR 03.039 Molekulaarne mikrobioloogia, alates 2005 sügissemestrist
5)BGMR 03.036 Geneetika praktikum

Konverentside korraldamine:
NATO Advanced Research Workshop „Bioremediation of soils contaminated with aromatic compounds: effects of rhizosphere, bioavailability, gene regulation and stress adaptation“. 1-3 Juuli 2004, Tartu, Eesti.

Muu tegevus:
1) Toimetuskolleegiumi liige ASM ajakirjas „Applied and Environmental Microbiology“ ning "European Journal of Biology". Lisaks olen sageli retsenseerinud ka teistesse rahvusvaheliste CC teadusajakirjadesse saadetud artiklite käsikirju (näiteks „Journal of Bacteriology“ ja „Microbiology“).
2) Eesti Teadusfondi Keemia ja Molekulaarbioloogia ekspertkomisjoni liige.
3) ASM (American Society for Microbiology) liige.
4) EMÜ (Eesti Mikrobioloogide Ühendus) liige (juhatuses).

Olen osalenud TÜMRI, Geeni ja Keskkonnatehnoloogia Tippkeskuse ja Bioloogia-geograafia teaduskonna nõukogude töös
12.Juhendamisel kaitstud
väitekirjad

Andres Tover, PhD, 2005, juh. Maia Kivisaar. Regulation of transcription of the phenol degradation pheBA operon in Pseudomonas putida. Tartu Ülikool, TÜMRI

Marta Putrins, MSc, 2004, juh. Maia Kivisaar ja Andres Tover. Rakkude füsioloogilisest seisundist tulenevad kontrollmehhanismid Pseudomonas putida fenooli degradatsiooni operoni pheBA regulatsioonil. Tartu Ülikool, TÜMRI

Radi Tegova, MSc, 2004, juh. Maia Kivisaar ja Andres Tover. DNA polümeraas IV osalus Pseudomonas putida rakkudes toimuvates mutatsiooniprotsessides. Tartu Ülikool, TÜMRI

Rita Hõrak, PhD, 2002, juh. Maia Kivisaar. Regulation of transposition of transposon Tn4652 in Pseudomonas putida. Tartu Ülikool, TÜMRI

Signe Saumaa, MSc, 2002, juh. Maia Kivisaar. DNA reparatsioonisüsteemide mõju mutatsioonispektri muutustele Pseudomonas putida kultuuri pikemaajalisel nälgimisel. Tartu Ülikool, TÜMRI

Ülle Saks, MSc, 2002, juh. Maia Kivisaar ja Andres Tover. cis-cis-mukonaadi hulk Pseudomonas putida rakkudes - limiteeriv faktor pheBA promootori transkriptsiooni regulatsioonil.. Tartu Ülikool, TÜMRI

Heili Ilves, MSc, 2001, juh. Maia Kivisaar ja Rita Hõrak. Pseudomonas putida transposooni Tn4652 transpositsiooni regulatsioon. Tartu Ülikool, TÜMRI

Eve-Ly Ojangu, MSc, 1999, juh. Maia Kivisaar ja Andres Tover. Transposoon Tn4652 pöördkordusjärjestuste ja pheBA operoni baasil moodustunud liitpromootoritelt lähtuva transkriptsiooni sigmaS-sõltuvuse uurimine Pseudomonas putida rakkudes. Tartu Ülikool, TÜMRI

Gabriela Lasn, MSc, 1999, juh. Maia Kivisaar ja Lagle Kasak. Testsüsteemi konstrueerimine mutatsiooniprotsesside uurimiseks nälgivates Pseudomonas putida ja Escherichia coli rakkudes. Tartu Ülikool, TÜMRI

Jana Zernant, MSc, 1998, juh. Maia Kivisaar. Fenooli lagundamist määrava pheBA operoni transkriptsiooni regulatsioon pinnasebakteris Pseudomonas putida. Tartu Ülikool, TÜMRI

Lagle Kasak, MSc, 1998, juh. Maia Kivisaar. Mutatsiooniprotsessid nälgivas bakterirakus. Tartu Ülikool, TÜMRI

Rita Hõrak, MSc, 1998, juh. Maia Kivisaar. IHF soodustab Tn4652 transposaasi geeni tnpA avaldumist. Tartu Ülikool, TÜMRI

Andres Tover, MSc, 1997, juh. Maia Kivisaar. pheBA operoni transkriptsiooni regulatsioon. Tartu Ülikool, TÜMRI

Aili Kallastu, MSc, 1996, juh. Maia Kivisaar. Uus IS element IS1411: elemendi iseloomustamine ja osalemine fenooli lagundamist määrava pheBA operoni transkriptsiooni aktivatsioonil. Tartu Ülikool, TÜMRI

Riho Teras, MSc, 1996, juh. Maia Kivisaar. Transposooni Tn4652 ja pheBA operoni baasil tekkinud liitpromootoritelt lähtuva transkriptsiooni moduleerimine Tn4652 otsmiste järjestuste poolt bakteris Pseudomonas putida. Tartu Ülikool, TÜMRI
13.Teadustöö põhisuunad a) Stressi poolt indutseeritud mutageneesi molekulaarsed alused bakterites.
Uurime mutatsioonide tekkemehhanismide molekulaarseid aluseid perekond Pseudomonas bakterites, kontsentreerudes nii transpositsiooni reguleerivatele mehhanismidele kui ka vigutekitavate DNA polümeraaside osalusele stressi poolt indutseeritud mutageneesil.
b) Kasvukeskkonna mõju fenooli katabolismile bakteris Pseudomonas putida
Uurime füsioloogilisi kontrollmehhanisme, mis mõjutavad fenooli lagundamist määravate geenide pheBA transkriptsiooni bakteris P. putida ning fenooli ja bensoaadi lagundamise efektiivsust bakterite erinevates kasvukeskkondades.
14.Jooksvad grandid 1) Howard Hughes Medical Institute (HHMI) grant HHMI#55000316 “Study of regulation of genetic rearrangements in Pseudomonas.” (2001-2005), 50000 USD aastas (kokku 250000 USD).
2) ETF grant 5757 (01.01.2004 – 31.12.2007). Stressi poolt indutseeritud mutageneesi molekulaarsed alused. Projektile on eraldatud raha 200000 krooni aasta kohta nii 2004 kui ka 2005. aastaks.
3) ETF grant 5758 (01.01.2004 – 31.12.2007). Kasvukeskkonna mõju fenooli katabolismile bakteris Pseudomonas putida. Projektile on eraldatud raha 95000 krooni aasta kohta nii 2004 kui ka 2005. aastaks.
15.Teaduspublikatsioonid

Tark, M., A. Tover, K. Tarassova, R. Tegova, G. Kivi, R. Hõrak, and M. Kivisaar. 2005. A DNA polymerase V homologue encoded by TOL plasmid pWW0 confers evolutionary fitness on Pseudomonas putida under conditions of environmental stress. J. Bacteriol. 187:5203-5213.

Hõrak, R., H. Ilves, P. Pruunsild, M. Kuljus, and M. Kivisaar. 2004. The ColR-ColS two-component signal transduction system is involved in regulation of Tn4652 transposition in Pseudomonas putida under starvation conditions. Mol. Microbiol. 54:795-807.

Ilves, H., Hõrak, R., Teras, and M. Kivisaar. 2004. IHF is limiting host factor in transposition of Pseudomonas putida transposon Tn4652 in stationary phase. Mol. Microbiol 51:1773-85.

Kivisaar, M. 2004. Transposition and other mutational processes in Pseudomonas. In: Ramos J.L. (Ed.) The Pseudomonads, Vol I. Genomics, life style and molecular architecture. Kluver Academic/Plenum Publishers, New York, U.S.A. pp. 261-316.

Neumann, G., R. Teras, L. Monson, M. Kivisaar, F. Schauer, and H.J. Heipieper. 2004. Simultaneous degradation of atrazine and phenol by Pseudomonas sp. strain ADP: effects of toxicity and adaptation. Appl. Environ. Microbiol. 70:1907-1912.

Tegova, R., A. Tover, K. Tarassova, M. Tark, and M. Kivisaar. 2004. Involvement of error-prone DNA polymerase pol IV on stationary phase mutagenesis in Pseudomonas putida. J. Bacteriol. 186:2735-44.

Kivisaar, M. 2003. Stationary-phase mutagenesis: mechanisms that accelerate adaptation of microbial population under environmental stress. Environ. Microbiol. 5:814-827.

Saumaa, S., A. Tover, L. Kasak, and M. Kivisaar. 2002. Different spectra of stationary-phase mutations in early-arising versus late-arising mutants of Pseudomonas putida: involvement of the DNA repair enzyme MutY and the stationary-phase sigma factor RpoS. J. Bacteriol. 184:6957-6965.

Ilves, H., R. Hõrak, and M. Kivisaar. 2001. Involvement of sigma(S) in starvation-induced transposition of Pseudomonas putida transposon Tn4652. J. Bacteriol. 183:5445-5448.

Ojangu, E., Tover, A., Teras, R., and M. Kivisaar. 2000. Effect of combination of different –10 hexamers and downstream sequences on stationary phase-specific sigma factor S-dependent transcription in Pseudomonas putida. J. Bacteriol. 182:6707-6713

Teras, R., R. Hõrak, and M. Kivisaar. 2000. Transcription from fusion promoters generated during transposition of transposon Tn4652 is positively affected by integration host factor in Pseudomonas putida. J. Bacteriol.182:589-598.

Tover, A., E. L. Ojangu, and M. Kivisaar. 2001. Growth medium composition-determined regulatory mechanisms are superimposed on CatR-mediated transcription from the pheBA and catBCA promoters in Pseudomonas putida. Microbiology 147:2149-2156.

Tover, A., J. Zernant, S. A. Chugani, A. M. Chakrabarty, and M. Kivisaar. 2000. Critical nucleotides in the interaction of CatR with the pheBA promoter: conservation of the CatR-mediated regulation mechanisms between the pheBA and catBCA operons. Microbiology. 146:173-183.

viimati muudetud: 05.10.2005

Curriculum Vitae (CV)
1.First Name Maia
2.Surname Kivisaar
3.Institution Institute of Molecular and Cell Biology at Tartu University
4.Position Associate Professor at Department of Genetics
5.Date of birth 02.06.1960 (day.month.year)
6.Education Graduated at Tartu University in 1983 (biology);
PhD in molecular biology at Tartu University in 1992;
Short-term EMBO postdoctoral fellowship in BMC (Uppsala University) in 1994.
7.Research and
professional experience		 1983-1986 Scientist, Dept. Genetics and Cytology, Tartu University,
1986-1991 Scientist, Laboratory of Plasmid Biology, Tartu University
1991-1992 Scientist, IMCB, Tartu University
1992-1993 Senior Scientist, IMCB, Tartu University
1993-currently Associate Professor, IMCB, Tartu University
8.Academic degree PhD in Molecular Biology
9.Dates and sites of
earning the degrees		 University of Tartu, 1992
10.Honours/awards 1992 National Science Prize
2005 National Science Prize for Chemistry and Molecular Biology: award for scientific research (publications 2001-2004) on molecular mechanisms of mutagenesis and genetic adaptation of bacteria under conditions of environmental stress
11.Research-administrative
experience		 Teaching:
1) BGMR 03.034 Genetics 1 (2 CP); 350 students per year. The aim of this course is to give an overview of concepts of classical genetics, including quantitative genetics, and core concepts of molecular genetics.
2) BGMR 03.035 Genetics 2 (2 CP); 150 students per year. This course presents advanced topics in molecular genetics, regulation of gene expression and genetic bases of development, behaviour, immunity and cancer, and gives an introduction to population and evolutionary genetics.
3) BGMR 03.030 Physiology of the Bacterial Cell: a Molecular Approach (2 CP); 20 students per year.
4)BGMR 03.039 Molecular Microbiology, since 2005 November
5)BGMR 03.036 Practical Course in Genetics

Scientific meetings organized:
1) NATO Advanced Research Workshop „Bioremediation of soils contaminated with aromatic compounds: effects of rhizosphere, bioavailability, gene regulation and stress adaptation“. 1-3 July 2004, Tartu, Estonia.
1) Member of the scientific committee of 10th International Congress on Pseudomonas (Pseudomonas 2005, Marseille).

Other activities:
1) Member of the Editorial Board of "Applied and Environmental Microbiology" and "Central European Journal of Biology".
Additionally, I have been a frequent reviewer for other scientific journals (e.g., Journal of Bacteriology).
2) I have evaluated grant applications for Estonian Science Foundation
3) Member of ASM (American Society for Microbiology)
4) Member of Estonian Society for Microbiologists in a board

I have worked in the councils of IMCB, Center of Excellence of Gene and Environmental Technology, and faculty of Biology and Geography.
12.Supervised dissertations

Andres Tover, PhD, 2005, superv. Maia Kivisaar. Regulation of transcription of the phenol degradation pheBA operon in Pseudomonas putida. Tartu Ülikool, TÜMRI

Marta Putrins, MSc, 2004, superv. Maia Kivisaar ja Andres Tover. Rakkude füsioloogilisest seisundist tulenevad kontrollmehhanismid Pseudomonas putida fenooli degradatsiooni operoni pheBA regulatsioonil. Tartu Ülikool, TÜMRI

Radi Tegova, MSc, 2004, superv. Maia Kivisaar ja Andres Tover. DNA polümeraas IV osalus Pseudomonas putida rakkudes toimuvates mutatsiooniprotsessides. Tartu Ülikool, TÜMRI

Rita Hõrak, PhD, 2002, superv. Maia Kivisaar. Regulation of transposition of transposon Tn4652 in Pseudomonas putida. Tartu Ülikool, TÜMRI

Signe Saumaa, MSc, 2002, superv. Maia Kivisaar. DNA reparatsioonisüsteemide mõju mutatsioonispektri muutustele Pseudomonas putida kultuuri pikemaajalisel nälgimisel. Tartu Ülikool, TÜMRI

Ülle Saks, MSc, 2002, superv. Maia Kivisaar ja Andres Tover. cis-cis-mukonaadi hulk Pseudomonas putida rakkudes - limiteeriv faktor pheBA promootori transkriptsiooni regulatsioonil.. Tartu Ülikool, TÜMRI

Heili Ilves, MSc, 2001, superv. Maia Kivisaar ja Rita Hõrak. Pseudomonas putida transposooni Tn4652 transpositsiooni regulatsioon. Tartu Ülikool, TÜMRI

Eve-Ly Ojangu, MSc, 1999, superv. Maia Kivisaar ja Andres Tover. Transposoon Tn4652 pöördkordusjärjestuste ja pheBA operoni baasil moodustunud liitpromootoritelt lähtuva transkriptsiooni sigmaS-sõltuvuse uurimine Pseudomonas putida rakkudes. Tartu Ülikool, TÜMRI

Gabriela Lasn, MSc, 1999, superv. Maia Kivisaar ja Lagle Kasak. Testsüsteemi konstrueerimine mutatsiooniprotsesside uurimiseks nälgivates Pseudomonas putida ja Escherichia coli rakkudes. Tartu Ülikool, TÜMRI

Jana Zernant, MSc, 1998, superv. Maia Kivisaar. Fenooli lagundamist määrava pheBA operoni transkriptsiooni regulatsioon pinnasebakteris Pseudomonas putida. Tartu Ülikool, TÜMRI

Lagle Kasak, MSc, 1998, superv. Maia Kivisaar. Mutatsiooniprotsessid nälgivas bakterirakus. Tartu Ülikool, TÜMRI

Rita Hõrak, MSc, 1998, superv. Maia Kivisaar. IHF soodustab Tn4652 transposaasi geeni tnpA avaldumist. Tartu Ülikool, TÜMRI

Andres Tover, MSc, 1997, superv. Maia Kivisaar. pheBA operoni transkriptsiooni regulatsioon. Tartu Ülikool, TÜMRI

Aili Kallastu, MSc, 1996, superv. Maia Kivisaar. Uus IS element IS1411: elemendi iseloomustamine ja osalemine fenooli lagundamist määrava pheBA operoni transkriptsiooni aktivatsioonil. Tartu Ülikool, TÜMRI

Riho Teras, MSc, 1996, superv. Maia Kivisaar. Transposooni Tn4652 ja pheBA operoni baasil tekkinud liitpromootoritelt lähtuva transkriptsiooni moduleerimine Tn4652 otsmiste järjestuste poolt bakteris Pseudomonas putida. Tartu Ülikool, TÜMRI
13.Current research program a) Molecular mechanisms of stress-induced mutagenesis in bacteria.
Study of molecular mechanisms of generation of mutations in Pseudomonas bacteria by concentrating on regulatory network controlling transposition and involvement of different error-prone DNA polymerases in stress-induced mutagenesis.
b) Effects of growth medium composition on phenol catabolism in P. putida.
Study of physiological control mechanisms regulating transcription of phenol degradation genes pheBA in P. putida and efficiency of degradation of phenol and benzoate under different growth conditions of bacteria.
14.Current grant funding 1) Howard Hughes Medical Institute (HHMI) International Scolars grant “Study of regulation of genetic rearrangements in Pseudomonas” HHMI#55000316 (2001-2005), 50,000 USD per year.
2) Grant 5757 from Estonian Science Foundation (01.01.2004-31.12.2007). Molecular mechanisms of stress-induced mutagenesis. 200,000 EEK per year.
3) Grant 5757 from Estonian Science Foundation (01.01.2004-31.12.2007). Study of the effect of growth media composition on phenol degradation in Pseudomonas putida. Molecular mechanisms of stress-induced mutagenesis. 95,000 EEK per year.
15.List of most important publications

Tark, M., A. Tover, K. Tarassova, R. Tegova, G. Kivi, R. Hõrak, and M. Kivisaar. 2005. A DNA polymerase V homologue encoded by TOL plasmid pWW0 confers evolutionary fitness on Pseudomonas putida under conditions of environmental stress. J. Bacteriol. 187:5203-5213.

Hõrak, R., H. Ilves, P. Pruunsild, M. Kuljus, and M. Kivisaar. 2004. The ColR-ColS two-component signal transduction system is involved in regulation of Tn4652 transposition in Pseudomonas putida under starvation conditions. Mol. Microbiol. 54:795-807.

Ilves, H., Hõrak, R., Teras, and M. Kivisaar. 2004. IHF is limiting host factor in transposition of Pseudomonas putida transposon Tn4652 in stationary phase. Mol. Microbiol 51:1773-85.

Kivisaar, M. 2004. Transposition and other mutational processes in Pseudomonas. In: Ramos J.L. (Ed.) The Pseudomonads, Vol I. Genomics, life style and molecular architecture. Kluver Academic/Plenum Publishers, New York, U.S.A. pp. 261-316.

Neumann, G., R. Teras, L. Monson, M. Kivisaar, F. Schauer, and H.J. Heipieper. 2004. Simultaneous degradation of atrazine and phenol by Pseudomonas sp. strain ADP: effects of toxicity and adaptation. Appl. Environ. Microbiol. 70:1907-1912.

Tegova, R., A. Tover, K. Tarassova, M. Tark, and M. Kivisaar. 2004. Involvement of error-prone DNA polymerase pol IV on stationary phase mutagenesis in Pseudomonas putida. J. Bacteriol. 186:2735-44.

Kivisaar, M. 2003. Stationary-phase mutagenesis: mechanisms that accelerate adaptation of microbial population under environmental stress. Environ. Microbiol. 5:814-827.

Saumaa, S., A. Tover, L. Kasak, and M. Kivisaar. 2002. Different spectra of stationary-phase mutations in early-arising versus late-arising mutants of Pseudomonas putida: involvement of the DNA repair enzyme MutY and the stationary-phase sigma factor RpoS. J. Bacteriol. 184:6957-6965.

Ilves, H., R. Hõrak, and M. Kivisaar. 2001. Involvement of sigma(S) in starvation-induced transposition of Pseudomonas putida transposon Tn4652. J. Bacteriol. 183:5445-5448.

Ojangu, E., Tover, A., Teras, R., and M. Kivisaar. 2000. Effect of combination of different –10 hexamers and downstream sequences on stationary phase-specific sigma factor S-dependent transcription in Pseudomonas putida. J. Bacteriol. 182:6707-6713

Teras, R., R. Hõrak, and M. Kivisaar. 2000. Transcription from fusion promoters generated during transposition of transposon Tn4652 is positively affected by integration host factor in Pseudomonas putida. J. Bacteriol.182:589-598.

Tover, A., E. L. Ojangu, and M. Kivisaar. 2001. Growth medium composition-determined regulatory mechanisms are superimposed on CatR-mediated transcription from the pheBA and catBCA promoters in Pseudomonas putida. Microbiology 147:2149-2156.

Tover, A., J. Zernant, S. A. Chugani, A. M. Chakrabarty, and M. Kivisaar. 2000. Critical nucleotides in the interaction of CatR with the pheBA promoter: conservation of the CatR-mediated regulation mechanisms between the pheBA and catBCA operons. Microbiology. 146:173-183.

last updated: 05.10.2005

[ sulge aken ]