| teema: | Geenide ekspressiooni analüüs (proteoomika) neuraalsetes tüvirakkudes ja in vitro diferentseerunud neuronites ja gliiarakkudes |
|---|---|
| tunnusnumber: | ETF5250 |
| projekti tüüp: | Eesti Teadusfondi grant |
| erialad: |
3. Arstiteadused |
| seisund: | lõppenud |
| asutus: | Tartu Ülikool |
| projekti juht: | Aavo-Valdur Mikelsaar |
| kestus: | 01.01.2002 - 31.12.2005 |
| kirjeldus: | Käesolevas töös planeeritakse uurida geenide avaldumist närvisüsteemi tüvirakkudes ja neist diferentseerunud närvirakkudes. Kavas on luua geenide tegevuse produktide (valkude) 2D-andmebaas selleks, et oleks võimalik analüüsida mitmesuguseid muutusi, mis rakkudes toimuvad normaalsetes tingimustes, geneetiliste defektide ja võõraste geenide transfekteerimisel. Plaanis on võrdlevalt uurida transkriptsioonifaktorite geenide avaldumise iseärasusi niihästi erinevast allikast saadud normaalsetes tüvirakkudes kui ka geneetiliselt defektsetest loodetest saadud tüvirakkudes ja ajukasvajatest pärit sfäärimoodustavates rakkudes enne ja pärast diferentseerumisele suunamist ja samuti siis, kui rakkudesse on transfekteeritud võõraid geene. Transfekteerimiseks kasutame DNA reparatsiooni ja replikatsioonifaktorite geene, uurimaks nende geenide integratsiooni stabiilsust ja üleekspressiooni (kui see eksisteerib) mõju transkriptsioonifaktorite ekspressioonile ja rakkude (rakuliinide) proteoomile tervikuna. Käesolevas töös planeeritakse ka luua uusi tööks vajalikke närvisüsteemi tüvirakkude liine niihästi iseeneslikult aborteerunud kui ka meditsiinilistel näidustustel (sealhulgas eelnevalt diagnoositud defektidega) eemaldatud loodete ajukoest. Loodavad rakuliinid on mõeldud ainult kasutamiseks uurimistöös, mitte ravieesmärkidel. Oodatavad tulemused: töö tulemusena pannakse alus neuraalsete tüvirakkude ja neist diferentseerunud närvirakkude geenide ekspressiooni andmebaasile (proteoomi 2D-geelelektroforeesi andmebaasile). Tehakse kindlaks transkriptsioonifaktorite geenide (>50) ekspressioonimuster niihästi normaalsetes kui ka geneetiliselt defektsetes in vitro kasvavates närvirakkudes ja loodetakse saada andmed selle kohta, kuidas see muster muutub võõraste geenide (siin DNA replikatsiooni ja reparatsioonifaktorite geenid) rakkudesse sisseviimisel. Luuakse ja võetakse kasutusele uusi uurimistegevuseks vajalikke neuraalsete tüvirakkude liine |
| projektiga seotud isikud | ||||
|---|---|---|---|---|
| nr | nimi | asutus | amet | |
| 1. | Ingrid Kalev | TÜ ÜMPI | doktorant | |
| 2. | Kalmer Karpson | AS LabAs | teadur | |
| 3. | Liina Kiho | TÜ ÜMPI | doktorant | |
| 4. | Olga Kostina | TÜ ÜMPI | doktorant | |
| 5. | Aavo-Valdur Mikelsaar | TÜ arstiteaduskond, ÜMPI | ÜMPI juhataja, inimese bioloogia ja geneetika professor | |
| 6. | Andres Piirsoo | TÜ ÜMPI | vanemteadur | |
| 7. | Piret Pärlist | TÜ ÜMPI | v. laborant | |
| 8. | Alar Sünter | TÜ ÜMPI | teadur | |