| teema: | Neeru ja sisekõrva defektide uurimine transgeense hiire mudelis |
|---|---|
| tunnusnumber: | ETF5265 |
| projekti tüüp: | Eesti Teadusfondi grant |
| erialad: |
1.9. Geneetika, füsioloogia ja mikrobioloogia 1.15. Zooloogia 3. Arstiteadused |
| seisund: | lõppenud |
| asutus: | Tartu Ülikool |
| projekti juht: | Illar Pata |
| kestus: | 01.01.2002 - 31.12.2003 |
| kirjeldus: | "Paired-box" perekonna transkriptsioonifaktorid (Pax) omavad tähtsat rolli paljude organite morfogeneesis. Mutatsioonid Pax2 geenis põhjustavad neeru ja sisekõrva arenguhäireid nii inimesel kui hiirel. Oleme leidnud, et Pax2 defektid on sarnased nendega, mis esinevad transkriptsioonifaktor GATA3 geeni suhtes mutantsel hiirel, kuid on vähem ulatuslikud. Neerus ja sisekõrvas kattub Pax2 ekspressioon osaliselt lähedase geeni, Pax8 ekspressiooniga, ning kuna erinevate Pax faktorite vahel esineb sageli vastastikust kompensatsiooni, võib oletada, et sarnane situatsioon esineb ka Pax2 ja Pax8 vahel. Käesolev projekt uurib Pax2 ja Pax8 poolt reguleeritavaid radasid embüonaalses arengus kasutades Pax2/Pax8 topelt-knockout hiire mudelit. Viimane saadakse olemasolevate Pax2 ja Pax8 knockout liinide ristamisel. Analüüsitakse fenotüüpi embrüotel, mis kannavad erinevaid kombinatsioone Pax2 ja Pax8 suhtes mutantsetest alleelidest, keskendudes neeru ja sisekõrva morfogeneesile. Selleks kasutame erinevaid geenekspressiooni analüüsi tehnikaid (in situ hübridisatsioon, immuundetektsioon, pöördtranskriptsioon-polümeraasi ahelreaktsioon kombineeritud kudede mikrodissektsiooniga), ning histoloogilisi ja rakkude proliferatsiooni ja apoptoosi tuvastamise meetodeid. Topelt-knockout mudelis uuritakse nende geenide ekspressiooni, millel on tuvastatud oluline funktsioon neerus ja/või sisekõrvas (GATA3, Nkx5.1, Foxi1 ja GDNF signaliseerimiskompleksi geenid). Sarnased analüüsid viiakse läbi ka GATA3 knockout mudelis. Selle projekti tulemusena defineeritakse Pax2 ja Pax8 roll arengus ja nende regulatoorsed seosed teiste neeru ja sisekõrva funktsiooni seisukohalt oluliste geenidega. See aitab kaasa haiguste molekulaarsete aluste väljaselgitamisele. |
| projektiga seotud isikud | ||||
|---|---|---|---|---|
| nr | nimi | asutus | amet | |
| 1. | Madis Jakobson | Tartu Ülikool | doktorant | |
| 2. | Kersti Lilleväli | Tartu Ülikool | doktorant | |
| 3. | Illar Pata | Tartu Ülikool bioloogia-geograafia | vanemteadur | |