| kirjeldus: |
Mitokondriaalse genoomi säilitamise eest vastutavate protsesside hulka kuuluvad kindlasti ka mitokondriaalse DNA replikatsioon ja segregatsioon. Kuigi S. cerevisiae süsteemis on eelkõige geneetiliste vahenditega defineeritud hulk mitokondriaalse DNA propageerimiseks vajalikke valke, puudub seni üldaksepteeritav replikatsiooni protsessi toimumise mudel. Antud projekti eesmärgiks on mõningate oluliste DNA metabolismi aspektide uurimine pärmi S. cerevisiae mitokondrites. Esiteks analüüsime nn. ori/rep järjestuste konserveerunud struktuuride rolli in vivo ja hiljem in vitro eesmärgiga identifitseerida olulised primaar ja sekundaarstruktuuri tasemel funktsioneerivad elemendid ja nendega interageeruvad valgud. Saadavad andmed on oluliseks alusmaterjaliks replikatsiooni initsiatsiooni detailide väljaarendamisele selles süsteemis. Teiseks analüüsime mtDNA sünteesi limiteerivaid faktoreid ja proovime välja töötada mudeli, mis seletaks mtDNA rakusisese hulga säilitamist suhteliselt konstantsel tasemel. Kolmandaks analüüsime mtDNA replikatsiooni ja rekombinatsiooni vaheprodukte kõrge lahutuvusvõimega 2D geelelektroforeesi meetoditega, mis annab ettekujutuse DNA molekulide topoloogiast ja võimaldab selgitada rekombinatiivsete protsesside rolli DNA sünteesi initsiatsioonil defektse ja metsikut tüüpi genoomiga mitokondrites. Neljandaks analüüsime mitokondriaalse DNA nukleoidide koosseisu kuuluvaid valgulisi faktoreid, nende funktsionaalset rolli nukleoidide struktuuri kujunemisel ja osa mitokondriaalse DNA segregatsioonil. Kõik käsitletavad küsimused on omavahel tihedalt seotud ning nendele lahenduste leidmine võimaldab oluliselt täiendada meie maailmapilti S. cerevisiae mitokondriaalse genoomi intaktsuse säilitamise mehhanismide suhtes |