teema: Inimese genoom II
tunnusnumber: SF0182582As03
projekti tüüp: sihtfinantseerimine
erialad: 1.6-1.9. Keemia ja molekulaarbioloogia
2. Tehnikateadused
3. Arstiteadused
seisund: käimasolev
asutus: Tartu Ülikool
projekti juht: Andres Metspalu
kestus: 01.01.2003 - 31.12.2007
kirjeldus: Projekt keskendub inimese genoomi alusuuringutele eesmärgiga koostada Eesti populatsiooni detailne iseloomustus koos LD kaardiga. Saadav informatsioon leiaks kohe kasutamist Geenivaramu projektis. Lisaks uurime geeniekspressiooni ja valkude sünteesi nii, et oleks võimalik lõpuks öelda, kuidas geneetilised markerid (SNP-d) on seotud mRNA ekspressiooniga ja sealt edasi valkude ekspressiooniga. Neid tulemusi saab kasutada ravimuuringutes. Põhilised meetodid, mida me kasutame nende eesmärkide saavutamiseks on: genotüpiseerimise tehnoloogia mikrokiibil (APEX kuni 60 000 markerini), mRNA ekspressioonianalüüs (cDNA mikrokiibid, kuni 35 000 cDNA-d) ja valkude analüüs (kromatograafia, 2-D elektroforees (aparatuur olemas), MALDI-TOF (koostöös) ja valgu mikrokiibid (juurutame ise). Võrdleva genoomika raames töötame hiire genoomiga, analüüsides nii kandidaatgeene haigustele kui ka K/O hiirte geeniekspressiooni võrdluses normaalsetega. Uue tehnoloogiana juurutame mikrokiipide in situ sünteesi, kasutades Febit tehnoloogiat. Eesti DNA proovid tulevad Geenivaramust, võrdlusmaterjal (Aasia, Aafrika, muu Euroopa) koostööpartneritelt. Kogu projekt eeldab tugevat bioinformaatika-alast toetust, mis on olemas.

projektiga seotud isikud
nr nimi asutus amet  
1.Aune AhmanTartu Ülikoolmagistrant 
2.Signe AltmäeTartu Ülikoolmagistrand 
3.Siiri AltrajaTartu Ülikoolv-teadur 
4.Reidar AndresonTartu Ülikooldoktorant 
5.Pille HallastTartu Ülikoolmagistrant 
6.Krista KaasikTÜMRIdoktornat 
7.Martin KadaiTÜMRImagistrand 
8.Kristi KallassaluTartu Ülikoolmagistrand 
9.Katrin KeppTartu Ülikoolmagistrant 
10.Maris KuningasTartu Ülikoolmagistrant 
11.Ants KurgTartu Ülikooldotsent 
12.Maris LaanTartu Ülikoolv-teadur 
13.Krista LiivTÜMRIsekretär 
14.Elin LõhmussaarTartu Ülikooldoktorant 
15.Andres MetspaluTartu Ülikoolprofessor 
16.Evelin MihailovTartu Ülikoolmagistrant 
17.Jaana MännikTÜMRIteadur 
18.Katrin MännikTartu Ülikoolmagisrtand 
19.Liina NagirnajaTÜMRImagistrand 
20.Mari NelisTartu Ülikoolmagistrant 
21.Tõnis OrgTartu Ülikoolmagistrant 
22.Kaie PillTÜMRIdoktorant 
23.Janne PullatTartu Ülikooldoktorant 
24.Tarmo PuurandTartu Ülikoolmagistrant 
25.Anu ReigoTartu Ülikooldoktorant 
26.Andres SalumetsTÜMRIteadur 
27.Heidi SaulepTÜMRIv-laborant 
28.Viljo SooTÜMRIv-laborant 
29.Jaana TammurTartu Ülikoolteadur 
30.Neeme TõnissonTÜMRIteadur 
31.Kristel VabritTÜMRImagistrand 
32.Kristajan VälkTÜMRImagistrand