| teema: | Inimese genoom II |
|---|---|
| tunnusnumber: | SF0182582Bs03 |
| projekti tüüp: | sihtfinantseerimine |
| erialad: |
1.6-1.9. Keemia ja molekulaarbioloogia 2. Tehnikateadused 3. Arstiteadused |
| seisund: | käimasolev |
| asutus: | Eesti Biokeskus |
| projekti juht: | Andres Metspalu |
| kestus: | 01.01.2003 - 31.12.2007 |
| kirjeldus: | Projekt keskendub inimese genoomi alusuuringutele eesmärgiga koostada Eesti populatsiooni detailne iseloomustus koos LD kaardiga. Saadav informatsioon leiaks kohe kasutamist Geenivaramu projektis. Lisaks uurime geeniekspressiooni ja valkude sünteesi nii, et oleks võimalik lõpuks öelda, kuidas geneetilised markerid (SNP-d) on seotud mRNA ekspressiooniga ja sealt edasi valkude ekspressiooniga. Neid tulemusi saab kasutada ravimuuringutes. Põhilised meetodid, mida me kasutame nende eesmärkide saavutamiseks on: genotüpiseerimise tehnoloogia mikrokiibil (APEX kuni 60 000 markerini), mRNA ekspressioonianalüüs (cDNA mikrokiibid, kuni 35 000 cDNA-d) ja valkude analüüs (kromatograafia, 2-D elektroforees (aparatuur olemas), MALDI-TOF (koostöös) ja valgu mikrokiibid (juurutame ise). Võrdleva genoomika raames töötame hiire genoomiga, analüüsides nii kandidaatgeene haigustele kui ka K/O hiirte geeniekspressiooni võrdluses normaalsetega. Uue tehnoloogiana juurutame mikrokiipide in situ sünteesi, kasutades Febit tehnoloogiat. Eesti DNA proovid tulevad Geenivaramust, võrdlusmaterjal (Aasia, Aafrika, muu Euroopa) koostööpartneritelt. Kogu projekt eeldab tugevat bioinformaatika-alast toetust, mis on olemas. |
| projektiga seotud isikud | ||||
|---|---|---|---|---|
| nr | nimi | asutus | amet | |
| 1. | Ants Aader | Eesti Biokeskus | bioinformaatik | |
| 2. | Signe Altmäe | Eesti Biokeskus | teadur | |
| 3. | Toomas Haller | Eesti Biokeskus | järeldoktor | |
| 4. | Krista Kaasik | Eesti Biokeskus | teadur | |
| 5. | Tiina Kahre | Eesti Biokeskus | teadur | |
| 6. | Kristi Kallassalu | Eesti Biokeskus | teadur | |
| 7. | Katrin Kepp | Eesti Biokeskus | teadur | |
| 8. | Maris Kuningas | Eesti Biokeskus | teadur | |
| 9. | Tiit Land | Eesti Biokeskus | külalisteadur | |
| 10. | Merike Leego | Eesti Biokeskus | projektijuht | |
| 11. | Tiit Lukk | Eesti Biokeskus | v-laborant | |
| 12. | Andres Metspalu | Eesti Biokeskus | ||
| 13. | Tiit Nikopensius | Eesti Biokeskus | teadur | |
| 14. | Janne Pullat | Eesti Biokeskus | teadur | |
| 15. | Hiljar Sibul | Eesti Biokeskus | teadur | |
| 16. | Maris Teder-Laving | Eesti Biokeskus | teadur | |
| 17. | Neeme Tõnisson | Eesti Biokeskus | teadur | |