teema: | Eestlaste ema- ja isaliinid fülogeograafilises kontekstis |
---|---|
tunnusnumber: | ETF6040 |
projekti tüüp: | Eesti Teadusfondi grant |
seisund: | käimasolev |
asutus: | Eesti Biokeskus |
projekti juht: | Kristiina Tambets |
kestus: | 01.01.2005 - 31.12.2008 |
kirjeldus: | Valdav osa uutest seisukohtadest inimese populatsioonigeneetika vallas tuleneb mitokondriaalse DNA (mtDNA) ja Y kromosoomi varieeruvuse uurimise andmetest. Nende haploidsete genoomide fülogeneetiliste puude topoloogia pidev täpsustumine ühes teadmiste kasvuga varieeruvuse fülogeograafiast teeb võimalikuks konkreetsete geeniliinide võimalikku päritolu analüüsi ajas ja ruumis, inimkonna demograafilise ajaloo rekonstrueerimise. Käesoleva projekti eesmärgiks on mõista eestlaste ja laiemas mõttes Läänemere idaosa rahvaste hulgas levinud haploidsete genoomivariantide fülogeneesi Euraasia rahvaste geneetilise varieeruvuse kontekstis. Töö baseerub meie ulatuslikel teadmistel Euraasia ja Aafrika rahvaste haploidsete genoomide fülogeneesist. Põhiliseks eksperimentaalseks lähenemiseks on mtDNA puhul genoomi kodeeriva ja kontrollregiooni polümorfismi detailne analüüs, k.a. resekveneerimine, Y kromosoomi puhul SNPde hierarhiline analüüs kombineerituna lühikeste kordusjärjestuste (STR-ide) varieeruvuse määramisega. Projekti analüütilise baasi moodustavad fülogeneesipuude rekonstrueerimine mediaanvõrgustike abil, molekulaarse kella, koalestsentsiteooria ja populatsioonibioloogiliste põhimeetodite kasutamine. Projekti tulemusena loodame rekonstrueerida geenivoogude aja ja suuna, mis on aluseks eestlaste ja nende lähinaabrite ema- ja isaliinide tänapäevasele varieeruvusele ning, sõltuvalt muudest projektidest, proovime saadud tulemusi seostada teadmistega eestlaste genofondi autosoomsete geenide varieeruvuses |
projektiga seotud isikud | ||||
---|---|---|---|---|
nr | nimi | asutus | amet | |
1. | Oleg Balanovski | EBK/Meditsiini-geneetika Keskus, Moskva | vanemteadur | |
2. | Ildus Kutuev | EBK/Biokeemia ja Geneetika Instituut, Ufaa | vanemteadur | |
3. | Eva-Liis Loogväli | Tartu Ülikool | doktorant | |
4. | Urmas Roostalu | Tartu Ülikool | doktorant | |
5. | Siiri Rootsi | Eesti Biokeskus | teadur | |
6. | Kristiina Tambets | Eesti Biokeskus | vanemteadur | |
7. | Helle-Viivi Tolk | Eesti Biokeskus | teadur | |
8. | Richard Villems | EBK/TÜ | direktor / professor |