teema: Interleukiin-10 perekonna tsütokiinide geenide polümorfismide seosed vitiliigoga.
tunnusnumber: ETF6576
projekti tüüp: Eesti Teadusfondi grant
erialad: 3.3. Kliiniline meditsiin
seisund: käimasolev
asutus: TÜ Arstiteaduskond
projekti juht: Külli Kingo
kestus: 01.01.2006 - 31.12.2009
kirjeldus: Projekti põhieesmärkideks on uurida interleukiin-10 (IL-10) ja tema perekonda kuuluvate tsütokiinide interleukiin-19 (IL-19), interleukiin-20 (IL-20) ja interleukiin-24 (IL-24) geneetiliste polümorfismide seoseid vitiliigoga ning hinnata IL-10, IL-19, IL-20 ja IL-24 (nii mRNA kui ka proteiini) ekspressioonitasemete erinevusi nahas tervetel kontrollidel ja vitiliigo haigetel. IL-10 geneetiliste polümorfismide tuvastamiseks kasutame ARMS-PCR meetodit ning IL-19, IL-20 ja IL-24 SNP-de tuvastamiseks tetra-ARMS-PCR meetodit. Kirjeldatud metoodikaid oleme edukalt kasutanud psoriaasiga haigetel IL-10, IL-19, IL-20 ja IL-24 ühenukleotiidsete polümorfismide tuvastamiseks. Tsütokiinide ekspressioone planeerime määrata kahel meetodil – nii mRNA kui ka valgu tasandil. Esimene meetod on IL-10, IL-19, IL-20 ja IL-24 geenide mRNA kvantiteerimine RT-PCR meetodil. Teine lähenemine on IL-10 ja IL-20 valguekspressiooni uurimine, mis seisneb rakukultuurides (keratinotsüüdid, melanotsüüdid) valgu taseme määramises ELISA meetodil; teiste interleukiinide taseme määramist praegu teha pole võimalik, kuna hetkel puuduvad sobivad meetodid. IL-10 ja tema perekonna tsütokiinide geneetiliste polümorfismide funktsionaalsete efektide selgitamiseks vitiliigo avaldumisel määrame nimetatud tsütokiinide ekspressioone eelnevalt genotüpeeritud haigetel ja tervetel kontrollidel. Seega püüab kirjeldatud lähenemine kombineerida genotüpeerimist funktsionaalsete muutustega. Selline uurimismetoodika annab võimaluse selgitada uuritavate tsütokiinide geenide funktsionaalset tähtsust haiguse tekkemehhanismis, kuna tuvastame nii uuritavate geenide variandid kui ka nende produktid. Varem IL-10 perekonna tsütokiinide geneetiliste polümorfismide seoseid vitiliigoga uuritud ei ole, mistõttu lisaks antud projekt olulist informatsiooni vitiliigo avaldumist mõjustavate geneetiliste markerite sedastamises. Samuti puuduvad andmed IL-19, IL-20 ja IL-24 ekspressiooni kohta nahas vitiliigoga haigetel.

projektiga seotud isikud
nr nimi asutus amet  
1.Maire Karelson 
2.Külli KingoTartu Ülikool 
3.Ranno Rätsep