teema: Antisense transkriptide osa geenide avaldamise kontrollis
tunnusnumber: ETF6597
projekti tüüp: Eesti Teadusfondi grant
erialad: 1.8. Molekulaarbioloogia
seisund: käimasolev
asutus: TÜ Bioloogia-geograafiateaduskond
projekti juht: Tarmo Annilo
kestus: 01.01.2006 - 31.12.2009
kirjeldus: Paljude valkekodeerivate geenide avaldumist kontrollivad lisaks regulatoorsetele järjestustele seonduvatele valgulistele faktoritele ka erinevad RNA molekulid nagu mikroRNAd ja vastasahelalt transkribeeritavad antisense RNAd. Käesolevas taotluses esitatud projekti eesmärgiks on selgitada, millist rolli mängivad antisense RNA molekulid kõrgvererõhutõve kujunemises oluliste geenide avaldumises. Selleks on planeeritud järgnevad spetsiifilised eesmärgid:
1. Kuna enamus antisense transkripte on seni kirjeldatud ainult in silico analüüsi abil, siis tuleb esmalt iseloomustada detailselt kõrgvererõhutõvega seotud geenide antisense transkriptide struktuuri, ekspressioonimustrit ja splaissingu isovorme.
2. Selgitada eksperimentaalselt, kas ja millist rolli omavad antisense transkriptid vastavate sense geenide ekspressiooni regulatsioonis.
3. Uurida sense-antisense geenipaaride evolutsioonilist konserveerumist selgroogsetel. Kas ja millisel määral on sense-antisense geenipaarid, nende asukoht genoomis ja kattumismuster konserveerunud?
4. Kirjeldada antisense transkriptide geneetilist variatsiooni ning uurida selle võimalikku seost ekspressioonimustri ning vererõhu regulatsiooni häiretega.

projektiga seotud isikud
nr nimi asutus amet  
1.Tarmo AnniloTartu Ülikool 
2.Siim Sõber