| kirjeldus: |
Käesolev projekt on eelmise granti ("Retroposoonide efekt inimese geenide epigeneetilisele regulatsioonile") edasiarendus. Kui varemalt tegime kindlaks, millised inimese geenid (>50) on L1 retrotransposooni poolt transkribeeritud, siis nüüd planeerime uurida fundamentaalsete geeniekspressiooni protsesside regulatsioonimehhanisme: transkriptsioonilist interferentsi (TI) ja RNA-RNA (sens-antisens RNA) interaktsioone. On oluline lisada, et TI kohta on varemalt tehtud ainult üksikuid töid ja kaksikahelalise RNA roll geeniekspressioonis on peaaegu täielikult uurimata ala. Töö käigus soovime leida vastuse sellistele põhilistele probleemidele: (1) Millise ulatusega võib L1 antisense promootor (ASP) põhjustada TI-d inimese geenide transkriptsioonis kui ASP paikneb geeni tõelise promootori suhtes kas konvergentses, divergentses või tandem asendis? (2) Kas L1 ASP poolt genereeritud asRNA on võimeline indutseerima geenivaigistamist, muutusi (alternatiivses) splaissingus, või põhjustab geeni varajast transkriptsiooni terminatsiooni? (3) Kas L1 ASP efekt avaldub transformeeritud ja/või normaalsetes rakkudes? Nende ülesannete lahendamine annab olulist täiendust või uut informatsiooni, mis senini on kirjanduses vähekirjeldatud või koguni puudunud, eriti aga TI ja L1 rolli kohta geeniekspessiooni regulatsioonis. |