teema: Semliki Forest viiruse replikatsioonisüsteemi ning viirus-peremees interaktsioonide uurimine ja kasutamine
tunnusnumber: ETF6609
projekti tüüp: Eesti Teadusfondi grant
erialad: 1.8. Molekulaarbioloogia
2.7. Bio- ja toiduainete tehnoloogia
3.1. Biomeditsiin
seisund: käimasolev
asutus: TÜ Bioloogia-geograafiateaduskond
projekti juht: Andres Merits
kestus: 01.01.2006 - 31.12.2007
kirjeldus: Semliki Forest viirus (SFV, perekond Alphavirus) on pikka aega olnud kasutusel mudelina viroloogilistes ja rakubioloogilistes uuringutes. Sellele vaatamata on paljud SFV molekulaarbioloogia (eriti viirus-peremees interaktsioonidega seotud) protsessid siiani ebaselged. Seepärast on kavandatud uurimuse peamiseks eesmärgiks viiruse replikatsiooni ja sellega kaasneva patogeensusega seotud fundamentaalsete protsesside väljaselgitamine ning uurimine. Kavandatud töö raames uuritakse SFV replikatsioonikompleksi moodustumist, rakulise stressi, metabolismi mahasurumise ja programmeeritud surma indutseerimist ning seoseid nende protsesside vahel. Samuti kavandatakse uurida ja iseloomustada SFV kodeeritud valkude, eriti nsP1 ja nsP2 valkude, potentsiaalseid rakulisi sihtmärke.
Nakatunud organismi tasandil on kavas uurida SFV levimise teid ja mehhanisme. Esimeseks etapiks sellises uurimuses on uudsete, marker geene kandvate, SFV genoomide konstrueerimine ja nende iseloomustamine. Teiseks kavandatavaks lähenemiseks on SFV infektsioonile reageerivate reporter-süsteemide konstrueerimine. Erilist tähelepanu kavandatakse pühendada uurimaks SFV infektsiooni rakkudes, mis on kas SFV produktiivsele infektsioonile resistentsed või milles SFV tekitab ajutise või persistentse infektsiooni.
Omandatud andmeid ja materjale kasutatakse uudsete omadustega geeniekspressiooni-süsteemide kavandamisel ja väljatöötamisel. Laboratoorsetes katsetes analüüsitakse loodud süsteemide omadusi, eriti nende potentsiaalset kasutamist geenivaktsiinide kandjatena ja vähivastase teraapia vektoritena.

projektiga seotud isikud
nr nimi asutus amet  
1.Kaja Kiiver 
2.Aleksei Lulla 
3.Andres MeritsTartu Ülikool 
4.Inga Sarand 
5.Valeria Sizemskaja 
6.Eva Žusinaite 
7.Ingrid Tagen 
8.Kairit Tints