teema: | Oligonukleotiidide kiibil põhineva transkriptsioonifaktorite määramise meetodi väljatöötlus, transkriptsioonifaktorite profileerimine basaalrakulistes kartsinoomides |
---|---|
tunnusnumber: | ETF6841 |
projekti tüüp: | Eesti Teadusfondi grant |
erialad: |
1.8. Molekulaarbioloogia 2.7. Bio- ja toiduainete tehnoloogia 3.1. Biomeditsiin |
seisund: | käimasolev |
asutus: | TTÜ Matemaatika-loodusteaduskond |
projekti juht: | Andres Valkna |
kestus: | 01.01.2006 - 31.12.2009 |
kirjeldus: | Transkriptsioonifaktorite profileerimine loob võimaluse nende üle- või alaekspressiooni kaudu kaudselt leida geenid, mille ekspressioon on häiritud ja mis seetõttu võivad olla seotud basaalrakulise kartsinoomi tekkega. Käesoleva projekti eesmärgiks on arendada välja metodoloogia määramaks transkriptsioonifaktorite profiile võrdlevalt normaalsete rakkudega (karvanääpsu keratinotsüüdid basaalrakulise kartsinoomi korral). Oleme välja töötanud sellise meetodi põhimõtte. See põhineb kaksikahelaliste oligonukleotiididel, mis on seotud kandjale. Need oligonukleotiidid sisaldavad transkriptsioonifaktorite konsensusjärjestusi, selle abil isoleeritakse spetsiifilised antud proteoomis esinevad transkriptsioonifaktorid. Transkriptsioonifaktorite profiilid määratakse fluorestsentssignaali alusel, vajadusel toimud nende identifitseerimine kasutades MALDI-TOF mass-spektroskoopiat. |
projektiga seotud isikud | ||||
---|---|---|---|---|
nr | nimi | asutus | amet | |
1. | Monika Drews | |||
2. | Kristiina Tamboom | |||
3. | Indrek Tammiste | |||
4. | Piret Tiigimägi | |||
5. | Andres Valkna | Tallinna Tehnikaülikooli Matemaatika-loodusteaduskond |