teema: Oligonukleotiidide kiibil põhineva transkriptsioonifaktorite määramise meetodi väljatöötlus, transkriptsioonifaktorite profileerimine basaalrakulistes kartsinoomides
tunnusnumber: ETF6841
projekti tüüp: Eesti Teadusfondi grant
erialad: 1.8. Molekulaarbioloogia
2.7. Bio- ja toiduainete tehnoloogia
3.1. Biomeditsiin
seisund: käimasolev
asutus: TTÜ Matemaatika-loodusteaduskond
projekti juht: Andres Valkna
kestus: 01.01.2006 - 31.12.2009
kirjeldus: Transkriptsioonifaktorite profileerimine loob võimaluse nende üle- või alaekspressiooni kaudu kaudselt leida geenid, mille ekspressioon on häiritud ja mis seetõttu võivad olla seotud basaalrakulise kartsinoomi tekkega. Käesoleva projekti eesmärgiks on arendada välja metodoloogia määramaks transkriptsioonifaktorite profiile võrdlevalt normaalsete rakkudega (karvanääpsu keratinotsüüdid basaalrakulise kartsinoomi korral). Oleme välja töötanud sellise meetodi põhimõtte. See põhineb kaksikahelaliste oligonukleotiididel, mis on seotud kandjale. Need oligonukleotiidid sisaldavad transkriptsioonifaktorite konsensusjärjestusi, selle abil isoleeritakse spetsiifilised antud proteoomis esinevad transkriptsioonifaktorid. Transkriptsioonifaktorite profiilid määratakse fluorestsentssignaali alusel, vajadusel toimud nende identifitseerimine kasutades MALDI-TOF mass-spektroskoopiat.

projektiga seotud isikud
nr nimi asutus amet  
1.Monika Drews 
2.Kristiina Tamboom 
3.Indrek Tammiste 
4.Piret Tiigimägi 
5.Andres ValknaTallinna Tehnikaülikooli Matemaatika-loodusteaduskond