| teema: | Modifitseeritud nukleosiidide roll ribosoomides |
|---|---|
| tunnusnumber: | ETF5822 |
| projekti tüüp: | Eesti Teadusfondi grant |
| erialad: |
1.8. Molekulaarbioloogia |
| seisund: | käimasolev |
| asutus: | TÜ Bioloogia-geograafiateaduskond |
| projekti juht: | Jaanus Remme |
| kestus: | 01.01.2004 - 31.12.2007 |
| kirjeldus: | Ribosoomi suure lahutusega struktuuri väljaselgitamine viimastel aastatel võimaldab uurida ribosoomi struktuuri ja funktsiooni seoseid atomaarsel tasemel, sealhulgas küsimusi, mida on püütud edutult lahendada juba kümneid aastaid. Üks selliseid aspekte on rRNA modifitseeritud nukleosiidid, mille võimalik funktsionaalne tähtsus on jäänud senini mõistatuslikuks. Käesolev projekt on pühendatud rRNA modfitseeritud nukleosiidide osa selgitamisele nii ribosoomi biogeneesil kui translatsioonil. Põhiline eksperimentaalne lähenemine modifitseeritud nukleosiidide ja neid sünteesivate ensüümide funktsioonide väljaselgitamisel on mutagenees, seda nii bakteri kromosoomi kui plasmiidsete geenide tasemel. Analüüsime E. coli tüvesid, milles on kas üks või mitu rRNA modifikatsiooniensüümi geen deleteeritud, ribosoomide moodustumise suhtes. Ribosoomide assambleerumise defektid väljenduvad eellaspartiklite kogunemises, mida tuvastame tsentrifuugimise meetodil. Teisest küljest analüüsime ka rRNA modifikatsioonide sünteesi sõltuvust ribosoomi subühikute assambleerimisest, millises ribosoomi kokkupanemise staadiumis tehakse erinevad modfitseeritud nukleosiidid rRNAs? Lisaks sellele uurime modifkatsioonide puudumise mõju translatsioonitäpsusele in vivo. |
| projektiga seotud isikud | ||||
|---|---|---|---|---|
| nr | nimi | asutus | amet | |
| 1. | Ülar Allas | Tartu Ülikool | doktorant | |
| 2. | Aivar Liiv | EBK | vanemteadur | |
| 3. | Ülo Maiväli | Tartu Ülikool | ||
| 4. | Lauri Peil | Tartu Ülikool | doktorant | |
| 5. | Jaanus Remme | TÜ Bioloogia-geograafiateaduskond | professor | |
| 6. | Kai Virumäe | vanemlaborant | ||